Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msgn1Q9JK54 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Msgn1Q9JK54 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Msgn1Q9JK54 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Msgn1Q9JK54 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Msgn1Q9JK54 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msgn1Q9JK54 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msgn1Q9JK54 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msgn1Q9JK54 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msgn1Q9JK54 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msgn1Q9JK54 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msgn1Q9JK54 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msgn1Q9JK54 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msgn1Q9JK54 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msgn1Q9JK54 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Msgn1Q9JK54 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msgn1Q9JK54 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msgn1Q9JK54 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msgn1Q9JK54 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msgn1Q9JK54 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msgn1Q9JK54 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msgn1Q9JK54 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msgn1Q9JK54 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msgn1Q9JK54 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msgn1Q9JK54 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msgn1Q9JK54 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msgn1Q9JK54 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msgn1Q9JK54 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msgn1Q9JK54 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msgn1Q9JK54 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msgn1Q9JK54 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msgn1Q9JK54 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Msgn1Q9JK54 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msgn1Q9JK54 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msgn1Q9JK54 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msgn1Q9JK54 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msgn1Q9JK54 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msgn1Q9JK54 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msgn1Q9JK54 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms