Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd3Q9JJY3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms