Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms