Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Sh3bgrlQ9JJU8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Sh3bgrlQ9JJU8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Sh3bgrlQ9JJU8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Sh3bgrlQ9JJU8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Sh3bgrlQ9JJU8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Sh3bgrlQ9JJU8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bgrlQ9JJU8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bgrlQ9JJU8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bgrlQ9JJU8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bgrlQ9JJU8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bgrlQ9JJU8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bgrlQ9JJU8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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