Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Bco1Q9JJS6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Bco1Q9JJS6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Bco1Q9JJS6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Bco1Q9JJS6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Bco1Q9JJS6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Bco1Q9JJS6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Bco1Q9JJS6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Bco1Q9JJS6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Bco1Q9JJS6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Bco1Q9JJS6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Bco1Q9JJS6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Bco1Q9JJS6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
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Bco1Q9JJS6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Bco1Q9JJS6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Bco1Q9JJS6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Bco1Q9JJS6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms