Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN5

Cpn1, Carboxypeptidase N catalytic chain, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpn1Q9JJN5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpn1Q9JJN5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpn1Q9JJN5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpn1Q9JJN5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpn1Q9JJN5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpn1Q9JJN5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpn1Q9JJN5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpn1Q9JJN5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpn1Q9JJN5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpn1Q9JJN5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpn1Q9JJN5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpn1Q9JJN5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpn1Q9JJN5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpn1Q9JJN5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpn1Q9JJN5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpn1Q9JJN5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpn1Q9JJN5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpn1Q9JJN5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpn1Q9JJN5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpn1Q9JJN5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpn1Q9JJN5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpn1Q9JJN5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpn1Q9JJN5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpn1Q9JJN5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpn1Q9JJN5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpn1Q9JJN5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpn1Q9JJN5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpn1Q9JJN5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpn1Q9JJN5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpn1Q9JJN5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpn1Q9JJN5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpn1Q9JJN5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpn1Q9JJN5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpn1Q9JJN5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpn1Q9JJN5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpn1Q9JJN5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpn1Q9JJN5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpn1Q9JJN5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpn1Q9JJN5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpn1Q9JJN5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpn1Q9JJN5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpn1Q9JJN5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpn1Q9JJN5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpn1Q9JJN5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpn1Q9JJN5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpn1Q9JJN5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpn1Q9JJN5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpn1Q9JJN5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpn1Q9JJN5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cpn1Q9JJN5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpn1Q9JJN5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpn1Q9JJN5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpn1Q9JJN5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpn1Q9JJN5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpn1Q9JJN5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpn1Q9JJN5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpn1Q9JJN5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpn1Q9JJN5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpn1Q9JJN5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpn1Q9JJN5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpn1Q9JJN5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpn1Q9JJN5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpn1Q9JJN5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpn1Q9JJN5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpn1Q9JJN5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpn1Q9JJN5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpn1Q9JJN5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpn1Q9JJN5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpn1Q9JJN5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpn1Q9JJN5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpn1Q9JJN5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpn1Q9JJN5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpn1Q9JJN5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cpn1Q9JJN5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpn1Q9JJN5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpn1Q9JJN5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpn1Q9JJN5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpn1Q9JJN5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpn1Q9JJN5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cpn1Q9JJN5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cpn1Q9JJN5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cpn1Q9JJN5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cpn1Q9JJN5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cpn1Q9JJN5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpn1Q9JJN5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpn1Q9JJN5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpn1Q9JJN5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpn1Q9JJN5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpn1Q9JJN5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpn1Q9JJN5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpn1Q9JJN5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpn1Q9JJN5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpn1Q9JJN5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpn1Q9JJN5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpn1Q9JJN5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpn1Q9JJN5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpn1Q9JJN5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpn1Q9JJN5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpn1Q9JJN5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpn1Q9JJN5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms