Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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