Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Cldn19Q9ET38 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Cldn19Q9ET38 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Cldn19Q9ET38 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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