Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms