Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rapgef4Q9EQZ6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rapgef4Q9EQZ6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rapgef4Q9EQZ6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rapgef4Q9EQZ6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rapgef4Q9EQZ6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rapgef4Q9EQZ6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rapgef4Q9EQZ6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rapgef4Q9EQZ6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rapgef4Q9EQZ6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rapgef4Q9EQZ6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rapgef4Q9EQZ6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rapgef4Q9EQZ6 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rapgef4Q9EQZ6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rapgef4Q9EQZ6 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms