Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ropn1lQ9EQ00 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms