Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms