Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufs3Q9DCT2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufs3Q9DCT2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufs3Q9DCT2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufs3Q9DCT2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufs3Q9DCT2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufs3Q9DCT2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufs3Q9DCT2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufs3Q9DCT2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufs3Q9DCT2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufs3Q9DCT2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufs3Q9DCT2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufs3Q9DCT2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufs3Q9DCT2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufs3Q9DCT2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufs3Q9DCT2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufs3Q9DCT2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms