Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim23Q9DAL0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms