Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAH1

Scp2d1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scp2d1Q9DAH1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms