Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tvp23bQ9D8T4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tvp23bQ9D8T4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tvp23bQ9D8T4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tvp23bQ9D8T4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tvp23bQ9D8T4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tvp23bQ9D8T4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tvp23bQ9D8T4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tvp23bQ9D8T4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tvp23bQ9D8T4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tvp23bQ9D8T4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tvp23bQ9D8T4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tvp23bQ9D8T4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tvp23bQ9D8T4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tvp23bQ9D8T4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tvp23bQ9D8T4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tvp23bQ9D8T4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tvp23bQ9D8T4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tvp23bQ9D8T4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tvp23bQ9D8T4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tvp23bQ9D8T4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tvp23bQ9D8T4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tvp23bQ9D8T4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tvp23bQ9D8T4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tvp23bQ9D8T4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tvp23bQ9D8T4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tvp23bQ9D8T4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tvp23bQ9D8T4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tvp23bQ9D8T4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tvp23bQ9D8T4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tvp23bQ9D8T4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tvp23bQ9D8T4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tvp23bQ9D8T4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tvp23bQ9D8T4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tvp23bQ9D8T4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tvp23bQ9D8T4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tvp23bQ9D8T4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tvp23bQ9D8T4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tvp23bQ9D8T4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tvp23bQ9D8T4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tvp23bQ9D8T4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tvp23bQ9D8T4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tvp23bQ9D8T4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tvp23bQ9D8T4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tvp23bQ9D8T4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms