Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1078.8 ms