Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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