Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7H3

RtcA, RNA 3'-terminal phosphate cyclase, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcAQ9D7H3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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RtcAQ9D7H3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RtcAQ9D7H3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RtcAQ9D7H3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RtcAQ9D7H3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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RtcAQ9D7H3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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RtcAQ9D7H3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RtcAQ9D7H3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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RtcAQ9D7H3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RtcAQ9D7H3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RtcAQ9D7H3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RtcAQ9D7H3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RtcAQ9D7H3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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RtcAQ9D7H3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RtcAQ9D7H3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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RtcAQ9D7H3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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RtcAQ9D7H3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RtcAQ9D7H3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RtcAQ9D7H3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RtcAQ9D7H3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RtcAQ9D7H3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RtcAQ9D7H3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RtcAQ9D7H3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RtcAQ9D7H3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RtcAQ9D7H3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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RtcAQ9D7H3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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RtcAQ9D7H3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RtcAQ9D7H3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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RtcAQ9D7H3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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RtcAQ9D7H3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RtcAQ9D7H3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RtcAQ9D7H3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RtcAQ9D7H3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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RtcAQ9D7H3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RtcAQ9D7H3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RtcAQ9D7H3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RtcAQ9D7H3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RtcAQ9D7H3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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RtcAQ9D7H3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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RtcAQ9D7H3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RtcAQ9D7H3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RtcAQ9D7H3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RtcAQ9D7H3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RtcAQ9D7H3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RtcAQ9D7H3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RtcAQ9D7H3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RtcAQ9D7H3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RtcAQ9D7H3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RtcAQ9D7H3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RtcAQ9D7H3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RtcAQ9D7H3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RtcAQ9D7H3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RtcAQ9D7H3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RtcAQ9D7H3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RtcAQ9D7H3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms