Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PudpQ9D5U5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms