Protein–RNA interactions for Protein: Q9D593

Atp6v1e2, V-type proton ATPase subunit E 2, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v1e2Q9D593 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp6v1e2Q9D593 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp6v1e2Q9D593 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp6v1e2Q9D593 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp6v1e2Q9D593 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp6v1e2Q9D593 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp6v1e2Q9D593 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp6v1e2Q9D593 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp6v1e2Q9D593 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp6v1e2Q9D593 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp6v1e2Q9D593 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp6v1e2Q9D593 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp6v1e2Q9D593 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp6v1e2Q9D593 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp6v1e2Q9D593 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp6v1e2Q9D593 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp6v1e2Q9D593 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp6v1e2Q9D593 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp6v1e2Q9D593 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp6v1e2Q9D593 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp6v1e2Q9D593 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp6v1e2Q9D593 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp6v1e2Q9D593 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp6v1e2Q9D593 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp6v1e2Q9D593 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp6v1e2Q9D593 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp6v1e2Q9D593 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp6v1e2Q9D593 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp6v1e2Q9D593 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp6v1e2Q9D593 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp6v1e2Q9D593 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp6v1e2Q9D593 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp6v1e2Q9D593 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp6v1e2Q9D593 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp6v1e2Q9D593 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp6v1e2Q9D593 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp6v1e2Q9D593 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp6v1e2Q9D593 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp6v1e2Q9D593 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms