Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrameQ9D4Z5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrameQ9D4Z5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrameQ9D4Z5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrameQ9D4Z5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrameQ9D4Z5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrameQ9D4Z5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrameQ9D4Z5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrameQ9D4Z5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrameQ9D4Z5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrameQ9D4Z5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrameQ9D4Z5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrameQ9D4Z5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrameQ9D4Z5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrameQ9D4Z5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrameQ9D4Z5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrameQ9D4Z5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrameQ9D4Z5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrameQ9D4Z5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrameQ9D4Z5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PrameQ9D4Z5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrameQ9D4Z5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrameQ9D4Z5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrameQ9D4Z5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrameQ9D4Z5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrameQ9D4Z5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrameQ9D4Z5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms