Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efhd1Q9D4J1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.3 ms