Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms