Protein–RNA interactions for Protein: Q9D328

Tmem35a, Transmembrane protein 35A, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35aQ9D328 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem35aQ9D328 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem35aQ9D328 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem35aQ9D328 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem35aQ9D328 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem35aQ9D328 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem35aQ9D328 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem35aQ9D328 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem35aQ9D328 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Tmem35aQ9D328 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem35aQ9D328 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem35aQ9D328 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem35aQ9D328 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem35aQ9D328 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem35aQ9D328 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem35aQ9D328 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem35aQ9D328 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Tmem35aQ9D328 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem35aQ9D328 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem35aQ9D328 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem35aQ9D328 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem35aQ9D328 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem35aQ9D328 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem35aQ9D328 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem35aQ9D328 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem35aQ9D328 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem35aQ9D328 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem35aQ9D328 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem35aQ9D328 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem35aQ9D328 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem35aQ9D328 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem35aQ9D328 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem35aQ9D328 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem35aQ9D328 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem35aQ9D328 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem35aQ9D328 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem35aQ9D328 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem35aQ9D328 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem35aQ9D328 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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