Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Mrpl28Q9D1B9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms