Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syf2Q9D198 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms