Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms