Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Q7

Mrpl45, 39S ribosomal protein L45, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl45Q9D0Q7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Mrpl45Q9D0Q7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl45Q9D0Q7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl45Q9D0Q7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl45Q9D0Q7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl45Q9D0Q7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl45Q9D0Q7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl45Q9D0Q7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl45Q9D0Q7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl45Q9D0Q7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl45Q9D0Q7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl45Q9D0Q7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl45Q9D0Q7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl45Q9D0Q7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl45Q9D0Q7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl45Q9D0Q7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl45Q9D0Q7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl45Q9D0Q7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl45Q9D0Q7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl45Q9D0Q7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl45Q9D0Q7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl45Q9D0Q7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl45Q9D0Q7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl45Q9D0Q7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl45Q9D0Q7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl45Q9D0Q7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl45Q9D0Q7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl45Q9D0Q7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl45Q9D0Q7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl45Q9D0Q7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl45Q9D0Q7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl45Q9D0Q7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl45Q9D0Q7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Mrpl45Q9D0Q7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl45Q9D0Q7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl45Q9D0Q7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Mrpl45Q9D0Q7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl45Q9D0Q7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl45Q9D0Q7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl45Q9D0Q7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl45Q9D0Q7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl45Q9D0Q7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Mrpl45Q9D0Q7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl45Q9D0Q7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl45Q9D0Q7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl45Q9D0Q7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl45Q9D0Q7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Mrpl45Q9D0Q7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl45Q9D0Q7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl45Q9D0Q7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Mrpl45Q9D0Q7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl45Q9D0Q7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl45Q9D0Q7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl45Q9D0Q7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl45Q9D0Q7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl45Q9D0Q7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl45Q9D0Q7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl45Q9D0Q7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl45Q9D0Q7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl45Q9D0Q7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl45Q9D0Q7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl45Q9D0Q7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl45Q9D0Q7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl45Q9D0Q7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl45Q9D0Q7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl45Q9D0Q7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl45Q9D0Q7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl45Q9D0Q7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl45Q9D0Q7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl45Q9D0Q7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl45Q9D0Q7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms