Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N7

Chaf1b, Chromatin assembly factor 1 subunit B, mousemouse

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1bQ9D0N7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Chaf1bQ9D0N7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Chaf1bQ9D0N7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Chaf1bQ9D0N7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Chaf1bQ9D0N7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Chaf1bQ9D0N7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Chaf1bQ9D0N7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Chaf1bQ9D0N7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Chaf1bQ9D0N7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Chaf1bQ9D0N7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chaf1bQ9D0N7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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