Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms