Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CYI0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CYI0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CYI0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CYI0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CYI0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CYI0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CYI0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CYI0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CYI0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CYI0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CYI0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CYI0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CYI0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CYI0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CYI0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CYI0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CYI0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CYI0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CYI0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CYI0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CYI0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CYI0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CYI0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CYI0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CYI0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CYI0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9CYI0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9CYI0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9CYI0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9CYI0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9CYI0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CYI0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CYI0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CYI0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CYI0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CYI0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CYI0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CYI0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms