Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms