Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX34

Sugt1, Protein SGT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sugt1Q9CX34 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sugt1Q9CX34 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms