Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms