Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV82

2310003L06Rik, RIKEN cDNA 2310003L06 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310003L06RikQ9CV82 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms