Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MINDY3Q9CV28 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MINDY3Q9CV28 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms