Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms