Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smurf1Q9CUN6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smurf1Q9CUN6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms