Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR78

Msantd3, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msantd3Q9CR78 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msantd3Q9CR78 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms