Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR02

Tma16, Translation machinery-associated protein 16, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tma16Q9CR02 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tma16Q9CR02 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tma16Q9CR02 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tma16Q9CR02 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tma16Q9CR02 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tma16Q9CR02 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tma16Q9CR02 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tma16Q9CR02 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tma16Q9CR02 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tma16Q9CR02 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tma16Q9CR02 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms