Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT1

Mri1, Methylthioribose-1-phosphate isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mri1Q9CQT1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms