Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS6

Gkn2, Gastrokine-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkn2Q9CQS6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gkn2Q9CQS6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms