Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc2Q9CQP2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms