Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rwdd1Q9CQK7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rwdd1Q9CQK7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rwdd1Q9CQK7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rwdd1Q9CQK7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rwdd1Q9CQK7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rwdd1Q9CQK7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rwdd1Q9CQK7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rwdd1Q9CQK7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rwdd1Q9CQK7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rwdd1Q9CQK7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rwdd1Q9CQK7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rwdd1Q9CQK7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rwdd1Q9CQK7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rwdd1Q9CQK7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rwdd1Q9CQK7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rwdd1Q9CQK7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rwdd1Q9CQK7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rwdd1Q9CQK7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rwdd1Q9CQK7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rwdd1Q9CQK7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rwdd1Q9CQK7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rwdd1Q9CQK7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rwdd1Q9CQK7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rwdd1Q9CQK7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rwdd1Q9CQK7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rwdd1Q9CQK7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rwdd1Q9CQK7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rwdd1Q9CQK7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rwdd1Q9CQK7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rwdd1Q9CQK7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rwdd1Q9CQK7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rwdd1Q9CQK7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rwdd1Q9CQK7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rwdd1Q9CQK7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rwdd1Q9CQK7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rwdd1Q9CQK7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rwdd1Q9CQK7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rwdd1Q9CQK7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rwdd1Q9CQK7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rwdd1Q9CQK7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rwdd1Q9CQK7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rwdd1Q9CQK7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rwdd1Q9CQK7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rwdd1Q9CQK7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rwdd1Q9CQK7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rwdd1Q9CQK7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rwdd1Q9CQK7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rwdd1Q9CQK7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rwdd1Q9CQK7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rwdd1Q9CQK7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rwdd1Q9CQK7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rwdd1Q9CQK7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rwdd1Q9CQK7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rwdd1Q9CQK7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rwdd1Q9CQK7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rwdd1Q9CQK7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rwdd1Q9CQK7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rwdd1Q9CQK7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rwdd1Q9CQK7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rwdd1Q9CQK7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rwdd1Q9CQK7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rwdd1Q9CQK7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rwdd1Q9CQK7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rwdd1Q9CQK7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rwdd1Q9CQK7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rwdd1Q9CQK7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rwdd1Q9CQK7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rwdd1Q9CQK7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rwdd1Q9CQK7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rwdd1Q9CQK7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rwdd1Q9CQK7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rwdd1Q9CQK7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rwdd1Q9CQK7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rwdd1Q9CQK7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rwdd1Q9CQK7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rwdd1Q9CQK7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rwdd1Q9CQK7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rwdd1Q9CQK7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rwdd1Q9CQK7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rwdd1Q9CQK7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rwdd1Q9CQK7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rwdd1Q9CQK7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rwdd1Q9CQK7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rwdd1Q9CQK7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rwdd1Q9CQK7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rwdd1Q9CQK7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rwdd1Q9CQK7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rwdd1Q9CQK7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rwdd1Q9CQK7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rwdd1Q9CQK7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rwdd1Q9CQK7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rwdd1Q9CQK7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rwdd1Q9CQK7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rwdd1Q9CQK7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rwdd1Q9CQK7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rwdd1Q9CQK7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Rwdd1Q9CQK7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rwdd1Q9CQK7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rwdd1Q9CQK7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms