Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ndufb9Q9CQJ8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ndufb9Q9CQJ8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms