Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTRAFQ9CQE8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
RTRAFQ9CQE8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
RTRAFQ9CQE8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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RTRAFQ9CQE8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTRAFQ9CQE8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTRAFQ9CQE8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTRAFQ9CQE8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTRAFQ9CQE8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTRAFQ9CQE8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTRAFQ9CQE8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTRAFQ9CQE8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTRAFQ9CQE8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTRAFQ9CQE8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTRAFQ9CQE8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTRAFQ9CQE8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RTRAFQ9CQE8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTRAFQ9CQE8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTRAFQ9CQE8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTRAFQ9CQE8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTRAFQ9CQE8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTRAFQ9CQE8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTRAFQ9CQE8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTRAFQ9CQE8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTRAFQ9CQE8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTRAFQ9CQE8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTRAFQ9CQE8 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTRAFQ9CQE8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTRAFQ9CQE8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTRAFQ9CQE8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTRAFQ9CQE8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTRAFQ9CQE8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTRAFQ9CQE8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTRAFQ9CQE8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTRAFQ9CQE8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTRAFQ9CQE8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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