Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ8

Cmc1, COX assembly mitochondrial protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmc1Q9CPZ8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmc1Q9CPZ8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms