Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms