Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms